Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD247P20963 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD247P20963 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms