Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRHP20396 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRHP20396 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRHP20396 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRHP20396 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRHP20396 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRHP20396 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRHP20396 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRHP20396 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRHP20396 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRHP20396 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRHP20396 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRHP20396 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHP20396 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHP20396 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRHP20396 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRHP20396 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHP20396 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
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