Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2CP19387 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms