Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF3P18847 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF3P18847 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF3P18847 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF3P18847 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF3P18847 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms