Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF3P17036 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms