Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACADSP16219 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms