Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DSPP15924 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DSPP15924 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DSPP15924 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms