Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms