Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB3P14651 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms