Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms