Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL2P13500 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL2P13500 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL2P13500 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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