Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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