Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms