Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf89P0DMQ9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms