Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC166P0CW27 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC166P0CW27 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms