Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPLO60437 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPLO60437 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPLO60437 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPLO60437 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPLO60437 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPLO60437 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPLO60437 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPLO60437 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPLO60437 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPLO60437 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPLO60437 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPLO60437 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPLO60437 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPLO60437 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPLO60437 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PPLO60437 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PPLO60437 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PPLO60437 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPLO60437 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPLO60437 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms