Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCEO43556 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCEO43556 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCEO43556 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCEO43556 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCEO43556 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCEO43556 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCEO43556 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCEO43556 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCEO43556 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCEO43556 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCEO43556 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCEO43556 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SGCEO43556 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGCEO43556 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGCEO43556 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGCEO43556 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGCEO43556 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGCEO43556 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGCEO43556 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGCEO43556 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGCEO43556 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGCEO43556 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGCEO43556 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCEO43556 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGCEO43556 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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SGCEO43556 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCEO43556 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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