Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TO15178 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TO15178 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms