Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms