Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF879B4DU55 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms