Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID3CA6NKF2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms