Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms