Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms