Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CHTOPQ9Y3Y2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms