Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT52Q9Y366 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms