Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms