Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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RAB23Q9ULC3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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RAB23Q9ULC3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB23Q9ULC3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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