Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXD3Q9UJU5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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FOXD3Q9UJU5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXD3Q9UJU5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXD3Q9UJU5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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