Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBE1Q9UJT0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms