Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYTH4Q9UIA0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms