Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms