Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms