Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms