Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms