Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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