Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FBXL12Q9NXK8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms