Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKDREJQ9NTG1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms