Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms