Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms