Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms