Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

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Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM2Q9C040 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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