Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1Q9C009 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 353 ms