Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSDMCQ9BYG8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms