Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAPERQ9BY12 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms