Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms