Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms