Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms