Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms