Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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GFI1Q99684 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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GFI1Q99684 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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GFI1Q99684 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1Q99684 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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