Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
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